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A Planet of Viruses

A Planet of Viruses

Carl Zimmer

Les virus, moteurs du vivant

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Description

En 1892, un botaniste russe du nom de Dmitri Ivanovski broie des feuilles de tabac malades, passe le jus à travers un filtre en porcelaine assez fin pour retenir n'importe quelle bactérie connue, et constate que le liquide reste contagieux. Quelque chose d'invisible, plus petit que le plus petit microbe, était passé au travers. Il ne comprend pas ce qu'il tient. Il faudra des décennies pour donner un nom à cet agent : virus, du latin qui voulait dire poison. Pendant longtemps, c'est bien comme ça qu'on les a vus — des poisons, des tueurs microscopiques, rien de plus.

C'est cette histoire que raconte Carl Zimmer, journaliste scientifique américain, dans un petit livre paru en 2011, A Planet of Viruses. Son propos tient en une bascule : on croit connaître les virus par leurs maladies — le rhume, la grippe, le sida, la variole — alors que la maladie n'est qu'une infime part de ce qu'ils sont et font. Les virus sont partout, en nombres qui dépassent l'imagination, et depuis bien plus longtemps que nous.

Zimmer part d'un chiffre qui donne le vertige : dans une seule goutte d'eau de mer, on trouve des centaines de millions de virus. Additionnés, ils pèseraient plus lourd que toutes les baleines de la planète. Et surtout, ils ne se contentent pas de nous rendre malades — ils ont façonné le vivant depuis ses origines, jusque dans notre propre ADN.

La question que l’on se pose : Et si les virus n'étaient pas d'abord des ennemis à combattre, mais l'une des forces qui ont sculpté la vie sur Terre — la nôtre comprise ?Ce que l’on va voir : Comment un poison invisible découvert dans des feuilles de tabac est devenu, dans le récit de Zimmer, l'acteur le plus discret et le plus puissant de l'histoire du vivant.

Sommaire

01

Chapitre 1 — Un million de virus dans une goutte d'eau

Le point de départ de Zimmer, c'est l'échelle. On imagine les virus comme des choses rares, tapies quelque part, prêtes à frapper. La réalité est l'inverse : ils forment de très loin l'entité biologique la plus abondante de la planète. Les océans en contiennent des quantités qu'on n'arrive pas vraiment à se représenter — de l'ordre de 10 puissance 31, soit un 1 suivi de trente et un zéros. Mis bout à bout, ils s'étireraient sur des dizaines de millions d'années-lumière.

Cette masse n'est pas inerte. Dans les mers, les virus tuent chaque jour une part énorme des bactéries marines, notamment ces cyanobactéries qui produisent une grande part de l'oxygène qu'on respire. En faisant éclater ces cellules, ils libèrent des milliards de tonnes de carbone et de nutriments dans l'eau, qui nourrissent à leur tour le reste de la chaîne. Zimmer le formule simplement : sans cette mise à mort permanente, l'équilibre chimique des océans, et donc du climat, ne serait pas ce qu'il est.

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02

Chapitre 2 — Le rhume, la grippe et la fabrique de la peur

Pourtant, la maladie existe, et Zimmer ne la minimise pas. Il commence par le plus banal : le rhume. Les rhinovirus qui nous encombrent le nez chaque hiver sont d'une bêtise génétique désarmante — quelques gènes à peine. Et malgré des décennies de recherche, on n'a jamais trouvé de remède, parce qu'ils existent en des centaines de variantes qui mutent sans cesse. Zimmer note un détail savoureux : un rhume n'est pas seulement subi, il rapporte. L'économie d'un pays perd des milliards en journées de travail à cause d'un virus qu'on n'a jamais réussi à vaincre.

La grippe est d'un tout autre calibre. Son génie tient à son instabilité. Le virus grippal se recombine facilement, mélangeant ses gènes entre souches humaines, aviaires et porcines. C'est ce brassage qui, à intervalles imprévisibles, produit une souche entièrement nouvelle contre laquelle presque personne n'est immunisé. Celle de 1918, la grippe dite espagnole, a tué en un ou deux ans plus de gens que la Première Guerre mondiale — les estimations vont de cinquante à cent millions de morts.

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03

Chapitre 3 — L'ennemi qu'on porte dans nos gènes

Voici sans doute l'idée la plus renversante du livre. Une partie des virus, les rétrovirus, ne se contentent pas d'infecter une cellule : ils insèrent leur propre code dans l'ADN de l'hôte. La plupart du temps, ça concerne des cellules ordinaires, et tout disparaît avec elles. Mais il arrive qu'un rétrovirus infecte une cellule reproductrice — un ovule, un spermatozoïde. Alors le virus devient héréditaire. Il se transmet aux enfants, aux petits-enfants, indéfiniment.

Sur des millions d'années, ce mécanisme s'est répété d'innombrables fois. Résultat : environ 8 % du génome humain est constitué de restes de virus anciens, incrustés là par nos ancêtres et fixés à jamais. On porte en nous les fossiles moléculaires d'infections vieilles de dizaines de millions d'années. La plupart sont désactivés, silencieux, réduits à l'état de vieux débris génétiques.

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04

Chapitre 4 — Ni vivants ni morts, mais in­dis­pen­sables

Reste une question que Zimmer laisse ouverte, et qui hante toute l'histoire des virus : sont-ils seulement vivants ? Un virus, hors d'une cellule, ne fait rien. Il ne mange pas, ne respire pas, ne se reproduit pas, ne bouge pas. C'est un paquet de gènes dans une coque de protéines, aussi inerte qu'un cristal. Il n'y a de la vie qu'au moment où il entre dans une cellule et détourne sa machinerie pour se copier. Selon la définition qu'on retient de la vie, le virus tombe à l'intérieur ou à l'extérieur — et cette indécision n'est pas un défaut de nos catégories, c'est une information sur la nature floue de la frontière du vivant.

Ce trouble déborde largement la biologie de laboratoire. Nous avons l'habitude de penser en termes de soi et d'étranger : notre corps d'un côté, les envahisseurs de l'autre, séparés par les remparts du système immunitaire. La leçon que Zimmer tire de la science virale dissout cette séparation. Une fraction non négligeable de ce que nous appelons "nous" — 8 % de notre ADN — est d'origine virale. L'étranger n'est pas seulement à l'extérieur en train de frapper à la porte. Il est à l'intérieur, incorporé, indispensable, indissociable de ce que nous sommes devenus.

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05

Conclusion

Du filtre de porcelaine d'Ivanovski aux centaines de millions de virus dans une goutte d'eau de mer, le livre de Zimmer opère un déplacement discret mais radical. Le virus commence l'histoire en poison invisible et la termine en co-auteur du vivant : régulateur des océans, fournisseur de gènes, bricoleur de notre placenta, locataire permanent de nos entrailles. La maladie, ce par quoi on croyait tout connaître d'eux, n'était que la part visible et bruyante d'une présence bien plus vaste et bien plus ancienne.

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